Наше село появилось на речке Лихоборке где-то в конце XVI века. Название произошло от имени Стефана Ховры, крымского грека, потомки которого, братья Ховрины, и основали Ховрино. История района – это история усадьбы «Грачевка» и Храма Знамения.
С 1700 года усадьбой владел граф Ф.А. Головин, потомок Ховриных. С 1813 года, после Отечественной войны, владельцем стал князь Н.П. Оболенский. В 1859 году село приобрел Е.В. Молчанов. А в 1895 году поместье досталось М.С. и В.Н. Грачевым. Старожилы говорили, что Грачев выиграл усадьбу в карты, но документального подтверждения этому найти не удалось.
Как усадьба, так и храм неоднократно перестраивались. Последний дворец выстроили Грачевы, и с тех пор парк называется Грачевкой. С 1917 года усадьба принадлежала сами знаете кому. В результате чего было ликвидировано кладбище и загнана под землю Лихоборка. На месте старого кладбища выстроен мемориал в память о защитниках Москвы.
В 1960 году село «попало» в черту Москвы. Здесь развернулось грандиозное экспериментальное строительство пятиэтажек. Человек, впервые оказавшийся в Ховрино, путается в нумерации типовых домов, которые расположены не параллельно, а «ёлочкой». На самом деле все оказывается просто. Правда, коренные жители на вопрос, где находится, например, дом 27 корпус 5 по улице Зеленоградской (на местном жаргоне – «двадцать семь пять», улица не говорится, поскольку нечетные дома есть только по Зеленоградской), будут долго рассуждать, размахивая руками в примерном направлении указанного объекта. Но это расположение домов давало положительный эффект: внутри микрорайона практически никогда не было ветра.
В конце 80-х рядом с Грачёвкой на Клинской улице начали грандиозную стройку – больницу на невиданное количество «койко-мест». В начале 90-х стройка прекратилась, и теперь это здание, похоже, никому не нужно.
А Знаменский Храм в 1991 году наконец-то вернули законному владельцу – Русской Православной Церкви.
Сейчас идет реконструкция района, снесли уже три пятиэтажки и построили несколько "небоскребов". Пожелаем удачи московским властям в этом нужном деле!